Claudia Kolm

2024

A novel ionic liquid‑based approach for DNA and RNA extraction simplifies sample preparation for bacterial diagnostics

Kolm, C., Kreuter, J., Bica-Schröder, K., Pálvölgyl, Á. M., Krska, R., Sommer, R., Farnleitner, A. & Reischer, G., Dez. 2024, in: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 416, 29, S. 7109-7120 12 S.

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Open Access

Assessing the impact of inland navigation on the faecal pollution status of large rivers: A novel integrated field approach

Steinbacher, S. D., Ameen, A., Demeter, K., Lun, D., Derx, J., Lindner, G., Sommer, R., Linke, R. B., Kolm, C., Zuser, K., Heckel, M., Perschl, A., Blöschl, G., Blaschke, A. P., Kirschner, A. K. T. & Farnleitner, A. H., 01 Sept. 2024, in: Water Research. 261, S. 122029 122029.

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Open Access

1 Zitat (Scopus)

Crenothrix polyspora, der Brunnenfaden i.e., die "Pest der Wasserleitungen": Populär - gefürchtet von 150 Jahren, heute ein seltenes Phänomen. - Eine Feldstudie.

Steinbacher, S., Leifels, M., Priselac, K., Demeter, K., Mayer, R., Vierheilig, J., Kandler, W., Lindner, G., Kolm, C., Blaschke, A. P., Savio, D., Kirschner, A. & Farnleitner, A., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Das ARISE Projekt: Wegbereiter für die Zukunft der Überwachung von antimikrobiellen Resistenzen im Abwasser

Kolm, C., Vierheilig, J., Kreuzinger, N., Zarfel, G., Stroebele, B., Finsterwald, M., Zepke, G., Martzy, R., Weinberger, J., Strauß, R., Lehner, A., Weber, J., Müller-Rechberger, H., Nykyforuk, L., Kirschner, A. & Farnleitner, A., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Development of a whole-cell SELEX process to select species-specific aptamers against Aspergillus niger

Ellena, V., Ioannou, A., Kolm, C., Farnleiter, A. H. & Steiger, M. G., 05 Nov. 2024, in: Fungal Biology and Biotechnology. 11, 1, S. 17 17.

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Open Access

Domestic hot-water boilers harbour active thermophilic bacterial communities distinctly different from those in the cold-water supply

Egli, T., Campostrini, L., Leifels, M., Füchslin, H. P., Kolm, C., Dan, C., Zimmermann, S., Hauss, V., Guiller, A., Grasso, L., Shajkofci, A., Farnleitner, A. H. & Kirschner, A., 01 Apr. 2024, in: Water Research. 253, S. 121109 121109.

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Open Access

2 Zitate (Scopus)

Eine neue DNA-Schnellextraktionsmethode für den molekularen Nachweis von uropathogenen Bakterien

Kreuter, J. (Vortragende:r), Priselac, K., Martzy, R., Pap, I.-J., Stroebele, B., Farnleitner, A., Reischer, G. & Kolm, C., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Einfluss der Schifffahrt auf die fäkale Belastung großer Flüsse: Ein neues Konzept für die integrative Evaluierung

Steinbacher, S. (Vortragende:r), Ameen, A., Demeter, K., Lun, D., Derx, J., Lindner, G., Sommer, R., Linke, R., Kolm, C., Zuser, K., Heckel, M., Perschel, A., Blöschl, G., Blaschke, A. P., Kirschner, A. & Farnleitner, A., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Feldtaugliche molekulare Schnelldiagnostik zur Unterstützung der Qualitätssicherung für die mobile Wasseraufbereitung im Katastrophenfall

Piglmann, L., Kreuter, J., Kolm, C., Sommer, R., Farnleitner, A., Kirschner, A. & Reischer, G., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Hat die DNA/RNA-Diagnostik fäkaler Belastungen die mikrobiologisch-hygienische Qualitätsanalyse von Wasser/Gewässern bereits revolutioniert?

Farnleitner, A. (Vortragende:r), Demeter, K., Linke, R., Ballesté, E., Reischer, G., Mayer, R., Vierheilig, J., Kolm, C., Stevenson, M. E., Derx, J., Kirschner, A., Sommer, R., Shanks, O. C., Blanch, A. R., Rose, J. B. & Ahmed, W., 15 Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Heparin-mediatet modulation of blood endotoxin-neutralizing compounds: implications on edotoxin activity and inflammatory response

Cont, D., Harm, S., Schildböck, C., Kolm, C., Kirschner, A., Farnleitner, A., Pilecky, M., Zottl, J., Hartmann, J. & Weber, V., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Linking Antibiotic Resistance Gene Patterns with Advanced Faecal Pollution Assessment and Environmental Key Parameters along 2300 km of the Danube River

Schachner-Groehs, I., Koller, M., Leopold, M., Kolm, C., Linke, R. B., Jakwerth, S., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M., Kandler, W., Sulyok, M., Vierheilig, J., Toumi, M., Farkas, R., Toth, E., Kittinger, C., Zarfel, G., Farnleitner, A. & Kirschner, A., 15 März 2024, in: Water Research. 252, S. 121244 121244.

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Open Access

6 Zitate (Scopus)

Potential der Detektion von viralen Partikeln in der Trinkwasseraufbereitung mittels hochauflösender Durchflusszytometrie

Kugler, D.-A., Reischer, G., Sommer, R., Farnleitner, A., Kirschner, A. & Kolm, C., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

SARS-CoV-2 Abwassersurveillance über die Pandemie hinaus – Möglichkeiten der Nutzung und Perspektiven für den Ausbau einer neuen/alten Methode in Wissenschaft und Öffentlicher Gesundheit am Beispiel Singapurs

Leifels, M. (Vortragende:r), Kolm, C., Kirschner, A., Lee, W. L., Chua, F. J. D., Ng, W. J., Nainani, D., Cheng, D., Farnleitner, A. & Thompson, J. R., 15 Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

The neutralizing effect of heparin on blood-derived antimicrobial compounds: impact on antibacterial activity and inflammatory response

Cont, D., Harm, S., Schildböck, C., Kolm, C., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. H., Pilecky, M., Zottl, J., Hartmann, J. & Weber, V., 22 März 2024, in: Frontiers in Immunology. 15, 1373255.

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Open Access

1 Zitat (Scopus)

Vienna Water Ressource Systems 2020+: eine 8-jährige interdisziplinäre Forschungskooperation zur Bewältigung zukünftiger Herausforderungen der Wasserversorgung, Teil 2

Mayer, R., Derx, J., Kirschner, A., Frick, C., Linke, R., Reischer, G., Kolm, C., Savio, D., Zuser, K., Demeter, K., Rehm, C., Pölz, A., Oudega, T. J., Lindner, G., Reiter, M., Schachner-Gröhs, I., Holzhammer, E., Schmid, A., Lettl, A. & Obeid, A. &12 mehr, Knetsch, S., Jakwerth, S., Schmidhuber, A., Steinbacher, S., Hirschmann, G., Leopold, M., Campostrini, L., Bindlechner, A., Stevenson, M. E., Sommer, R., Blaschke, A. P. & Farnleitner, A., Mai 2024.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

2023

A DNA-aptamer discovery platform for the generation of cell-recognition molecules for rapid water quality monitoring

Kolm, C., Cervenka, I., Baumann, N., Aschl, U. J., Sommer, R., Kirschner, A., Farnleitner, A. & Reischer, G., 04 Juni 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Antimicrobial resistance and environmental stressors: the One-Health perspective.

Vierheilig, J., Kolm, C., Dielacher, I., Schachner-Gröhs, I., Leopold, M., Koller, M., Kittinger, C., Zarfel, G., Farnleitner, A. & Kirschner, A., 19 Sept. 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Eingeladener Vortrag/Keynote bei einer Konferenz

Bacterial mock communities for flow cytometric analyses

Kolm, C., 11 Mai 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Eingeladener Vortrag/Keynote bei einer Konferenz

Concepts and solutions for rapid, on-site molecular diagnostics of microbiological water quality

Reischer, G., Kolm, C., Kreuter, J., Pesau, N., Martzy, R., Mach, R. L., Krska, R., Kirschner, A., Sommer, R. & Farnleitner, A., 04 Juni 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

First report on the occurrence of Vibrio cholerae nonO1/nonO139 in natural and artificial lakes and ponds in Serbia: Evidence for a long-distance transfer of strains and the presence of Vibrio paracholerae

Rehm, C., Lippert, K., Indra, A., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M., Leopold, M., Steinbacher, S., Schachner, I., Campostrini, L., Risslegger, A., Farnleitner, A. H., Kolm, C. & Kirschner, A. K. T., Apr. 2023, in: Environmental Microbiology Reports. 15, 2, S. 142-152 11 S.

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Open Access

3 Zitate (Scopus)

Have genetic targets for faecal pollution diagnostics and source tracking revolutionized water quality analysis yet?

Demeter, K., Linke, R., Ballesté, E., Reischer, G., Mayer, R. E., Vierheilig, J., Kolm, C., Stevenson, M. E., Derx, J., Kirschner, A. K. T., Sommer, R., Shanks, O. C., Blanch, A. R., Rose, J., Ahmed, W. & Farnleitner, A. H., 01 Juli 2023, in: FEMS Microbiology Reviews. 47, 4, fuad028.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift (peer-reviewed) › Artikel in Fachzeitschrift

Open Access

21 Zitate (Scopus)

Have genetic targets for faecal pollution diagnostics and source tracking revolutionized water quality analysis yet?

Demeter, K., Linke, R., Balleste, E., Reischer, G. H., Mayer, R., Vierheilig, J., Kolm, C., Stevenson, M. E., Derx, J., Kirschner, A., Sommer, R., Shanks, O. C., Blanch, A. R., Rose, J. B., Ahmed, W. & Farnleitner, A., 04 Juni 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

The neutralizing effect of heparin on human blood-derived antimicrobial peptides: impact on antibiotic defence and inflammatory responses

Cont, D., Harm, S., Schildböck, C., Kolm, C., Kirschner, A., Farnleitner, A., Hartmann, J. & Weber, V., 06 Sept. 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Towards the generation of Aspergillus-specific DNA aptamers to improve diagnosis of aspergillosis

Ellena, V., Kolm, C. & Steiger, M., 05 März 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Untersuchung von Antibiotikaresistenzen im Wasserkreislauf

Kolm, C., Schachner-Gröhs, I., Leopold, M., Vierheilig, J., Koller, M., Kittinger, C., Zarfel, G., Farnleitner, A. & Kirschner, A., 29 Juni 2023.

Publikation: Konferenzbeitrag › Eingeladener Vortrag/Keynote bei einer Konferenz

Vibrio cholerae-An emerging pathogen in Austrian bathing waters?

Rehm, C., Kolm, C., Pleininger, S., Heger, F., Indra, A., Reischer, G. H., Farnleitner, A. A. H. & Kirschner, A. K. T., Nov. 2023, in: Wiener Klinische Wochenschrift. The Central European Journal of Medicine. 135, 21-22, S. 597-608 12 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift (peer-reviewed) › Übersichtsartikel

Open Access

1 Zitat (Scopus)

Zwei Infektionen mit Vibrio alginolyticus nach Verletzungen mit Meerwasserkontakt.

Stroebele, B., Pap, I.-J., Platzer, P., Kolm, C. & Kirschner, A., 21 März 2023.

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2022

A quantitative concept to study the occurrence and spread of antimicrobial resistance along rivers

Leopold, M., Kabicher, A., Kolm, C., Koller, M., Linke, R., Kandler, W., Sulyok, M., Aspoeck, C., Pap, I.-J., Zarfel, G., Kittinger, C., Kirschner, A. & Farnleitner, A., 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Entwicklung neuartiger molekularer Detektionsmoleküle für hygienerelevante Bakterien in Wasser

Kolm, C., Cervenka, I., Baumann, N., Aschl, U., Sommer, R., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. H. & Reischer, G., Mai 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in biofilms and water samples in the Danube River

Kolm, C., Savio, D., Farnleitner, A., Kirschner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M. & Toth, E., 22 Sept. 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in the Danube River

Schachner, I., Kolm, C., Vierheilig, J., Savio, D., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R. B., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M., Toth, E., Farnleitner, A. & Kirschner, A. K. T., 2022, Electronic Abstract Book - FEMS Conference on Microbiology. 2 S.

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Beitrag in Konferenzband

Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in the Danube River. In Electronic Abstract Book - FEMS Conference on Microbiology

Kolm, C., Savio, D., Kirschner, A., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M. & Toth, E., 30 Juni 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Fäkale Verschmutzung als potenzielle Quelle von Antibiotikaresistenzgenen in der Donau

Kolm, C., Kirschner, A., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kračun-Kolarević, M., Kolarević, S. & Toth, E., 31 Mai 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Grundlagen der PCR-Analytik – von der Probenahme bis zur Auswertung: ÖWAV, Mikrobiologie und Wasser: Was DNA- & RNA-Analytik bereits alles für uns leisten, 14.6.2022, Wien, Österreich

Linke, R. & Kolm, C., 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Hydrophile ionische Flüssigkeiten für die rasche und einfache Extraktion von DNA und RNA aus Bakterien

Kolm, C., Farnleitner, A., Kreuter, J., Martzy, R., Pesau, N., Pálvölgyi, Á. M., Bica-Schröder, K., Sommer, R. & Reischer, G., 31 Mai 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Hydrophilic ionic liquids for the rapid and simple release of nucleic acids from bacteria

Kolm, C., Farnleitner, A., Kreuter, J., Martzy, R., Pesau, N., Pálvölgyi, Á. M., Bica-Schröder, K., Sommer, R. & Reischer, G., 03 Okt. 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Novel molecular detection and recognition molecules for health-relevant bacteria

Kolm, C., Cervenka, I., Baumann, N., Aschl, U., Sommer, R., Kirschner, A., Farnleitner, A. & Reischer, G., 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Risikoabschätzung und Kommunikation zu SARS-CoV-2 im Abwasser für die Österreichische Wasserwirtschaft: ein Rückblick zur gewählten Vorgangsweise

Farnleitner, A., Steinbacher, S., Kolm, C., Winischhofer, S., Novak, P., Wildt, S., Ertl, T. & Sommer, R., Mai 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Vibrio cholerae (non O1/non O139) in Badeseen: Nachweis, Quantifizierung und Vorhersage

Rehm, C., Kolm, C., Jakwerth, S., Pleininger, S., Herger, F., Lippert, K., Indra, A., Hein, T., Farnleitner, A., Reischer, G. & Kirschner, A. K. T., Juni 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

VIENNA WATER RESSOURCE SYSTEMS 2020+: Eine 8-jährige interdisziplinäre Forschungskooperation zur Bewältigung zukünftiger Herausforderungen der Wasserversorgung

Kolm, C., Mayer, R., Kirschner, A., Savio, D., Frick, C., Linke, R., Reischer, G., Nadiotis-Tsaka, T., Obeid, A., Jakwerth, S., Campostrini, L., Stevenson, M. E. & Ameen, A., 31 Mai 2022.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

2021

Extent and origin of fecal pollution in water and biofilms along the Danube River

Savio, D., Kirschner, A., Kolm, C., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Ixenmaier, S. & Linke, R., 09 Juni 2021.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Gefährdungspotential fäkalbürtiger SARS-CoV-2 Partikel im (Ab)wasser: eine Meta-Analyse zum Stand des Wissens

Farnleitner, A. H., Steinbacher, S., Winischhofer, S., Kolm, C. & Sommer, R., 2021.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Molecular faecal pollution diagnostics and source tracking: new approaches and future possibilities for rapid, inexpensive and on-site applicable water quality test systems: 13th Rapid Methods Europe (RME2021), 01.-03.02.2021, Online

Kolm, C., Reischer, G. H., Martzy, R. & Farnleitner, A. H., 2021.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Molecular fecal pollution diagnostics and source tracking: New approaches and future possibilities for rapid, inexpensive and on-site applicable water quality test systems

Kolm, C., Reischer, G., Martzy, R. & Farnleitner, A. H., 2021, Abstracts of Lectures & Posters.

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2020

DNA aptamers against bacterial cells can be efficiently selected by a SELEX process using state-of-the art qPCR and ultra-deep sequencing

Kolm, C., Cervenka, I., Aschl, U. J., Baumann, N., Jakwerth, S., Krska, R., Mach, R. L., Sommer, R., DeRosa, M. C., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. H. & Reischer, G. H., 01 Dez. 2020, in: Scientific Reports. 10, 1, S. 20917 20917.

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Open Access

40 Zitate (Scopus)

Gallium arsenide waveguides as a platform for direct mid-infrared vibrational spectroscopy

Haas, J., Stach, R., Kolm, C., Krska, R. & Mizaikoff, B., 01 Mai 2020, in: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 412, 14, S. 3447-3456 10 S.

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Open Access

3 Zitate (Scopus)

Molecular fecal pollution diagnostics for water quality testing: From polymerase chain reaction to rapid isothermal amplification to detect genetic fecal markers: Analytica Virtual 2020, Munich, Germany

Kolm, C., Reischer, G. H., Martzy, R. & Farnleitner, A. H., 2020.

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2019

Challenges and perspectives in the application of isothermal DNA amplification methods for food and water analysis

Martzy, R., Kolm, C., Krska, R., Mach, R. L., Farnleitner, A. H. & Reischer, G. H., 16 März 2019, in: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 411, 9, S. 1695-1702 8 S.

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Open Access

51 Zitate (Scopus)

Detection of a microbial source tracking marker by isothermal helicasedependent amplification and a nucleic acid lateralflow strip test

Kolm, C., Martzy, R., Führer, M., Mach, R. L., Krska, R., Baumgartner, S., Farnleitner, A. H. & Reischer, G., 2019, Abstractbook.

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Claudia Kolm

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