Alexander Kirschner

2022

Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in biofilms and water samples in the Danube River

Kolm, C., Savio, D., Farnleitner, A., Kirschner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M. & Toth, E., 22 Sept. 2022.

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Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in the Danube River

Schachner, I., Kolm, C., Vierheilig, J., Savio, D., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R. B., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M., Toth, E., Farnleitner, A. & Kirschner, A. K. T., 2022, Electronic Abstract Book - FEMS Conference on Microbiology. 2 S.

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Faecal pollution as potential driver of antibiotic resistance genes in the Danube River. In Electronic Abstract Book - FEMS Conference on Microbiology

Kolm, C., Savio, D., Kirschner, A., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M. & Toth, E., 30 Juni 2022.

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Fäkale Verschmutzung als potenzielle Quelle von Antibiotikaresistenzgenen in der Donau

Kolm, C., Kirschner, A., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Linke, R., Kračun-Kolarević, M., Kolarević, S. & Toth, E., 31 Mai 2022.

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From Groundwater to Drinking Water—Microbiology of Karstic Water Resources

Savio, D., Derx, J., Lang, R. P., Kirschner, A. K. T., Sommer, R., Blaschke, A. P., Küsel, K. & Farnleitner, A. H., 01 Jan. 2022, Encyclopedia of Inland Waters, Second Edition. Elsevier, Band 3. S. 560-579 20 S.

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1 Zitat (Scopus)

Klassifizierung und Herkunftsbestimmung fäkaler Verunreinigungen in Oberflächengewässern am Beispiel der Donau

Kirschner, A. K. T., Frick, C. & Farnleitner, A. H., 2022, ÖWAV-Arbeitsbehelf 52, Mikrobiologie und Wasser - Teil 2: Fallstudien zur Illustration der neuen diagnostisch-analytischen Möglichkeiten. Farnleitner, A. H., Kirschner, A. K. T., Frick, C., Proksch, P., Vogl, W., Schauer, U., Schrammel, B. & Zibuschka, F. (Hrsg.). Wien, Österreich: Österreichischer Wasser- und Abfallwirtschaftsverband, Wien, S. 16-19 4 S.

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Kultivierungsbasierte und kultivierungsunabhängige Methoden zur Bewertung der biologischen Stabilität von Grundwasser am Beispiel eines porösen Grundwasserleiters eines Flussuferfiltrationssystems

Kirschner, A. K. T., Lindner, G., Jakwerth, S., Vierheilig, J., van Driezum, I., Derx, J., Blaschke, A., Savio, D. F. & Farnleitner, A., Mai 2022.

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Microbial drinking water safety requirements of river catchments in view of global climate change – the QMRAcatch approach

Derx, J., Demeter, K., Komma, J., Parajka, J., Schijven, J., Sommer, R., Cervero-Aragó, S., Lindner, G., Zoufal-Hruza, C. M., Linke, R. B., Savio, D. F., Ixenmaier, S. K., Kirschner, A. K. T., Kromp, H., Blaschke, A. & Farnleitner, A., 2022.

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Modul: Automatisierung: Fluoreszenzspektroskopie als Proxyparameter für bakterielle Belastung im Karstwasser

Peer, S., Zoboli, O., Campostrini, L., Linke, R. B., Pölz, A., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A., Blaschke, A., Derx, J. & Zessner-Spitzenberg, M., 2022.

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Novel molecular detection and recognition molecules for health-relevant bacteria

Kolm, C., Cervenka, I., Baumann, N., Aschl, U., Sommer, R., Kirschner, A., Farnleitner, A. & Reischer, G., 2022.

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ÖWAV-Arbeitsbehelf 52, Mikrobiologie und Wasser - Teil 2: Fallstudien zur Illustration der neuen diagnostisch-analytischen Möglichkeiten

Farnleitner, A. H. (Herausgeber:in), Kirschner, A. K. T. (Herausgeber:in), Frick, C. (Herausgeber:in), Proksch, P. (Herausgeber:in), Vogl, W. (Herausgeber:in), Schauer, U. (Herausgeber:in), Schrammel, B. (Herausgeber:in) & Zibuschka, F. (Herausgeber:in), 2022, Wien, Österreich: Austrian Standards plus Publishing. (Arbeitsbehelfe des Österreichischen Wasser- und Abfallwirtschaftsverbandes (ÖWAV); Band 52, Nr. Teil 1)

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Screening von antibiotikaresistenten Bakterien menschlichen Ursprungs in urbanen Wasserressourcen

Strohhammer, T., Schachner-Gröhs, I., Frick, C., Ruzic, D., Zarfel, G., Farnleitner, A. & Kirschner, A., 31 Mai 2022.

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The Danube: Antimicrobial Resistance In The Enterobacteriaceae Population

Koller, M., Dielacher, I., Schachner, I., Jakwerth, S., Kirschner, A., Kolarević, S., Kračun-Kolarević, M., Toth, E., Melanie, L., Savio, D. F., Farnleitner, A., Kittinger, C. & Zarfel, G., 2022.

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Vibrio cholerae (non O1/non O139) in Badeseen: Nachweis, Quantifizierung und Vorhersage

Rehm, C., Kolm, C., Jakwerth, S., Pleininger, S., Herger, F., Lippert, K., Indra, A., Hein, T., Farnleitner, A., Reischer, G. & Kirschner, A. K. T., Juni 2022.

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Vibrio cholerae non-O1/non-O139: ein „Emerging Pathogen“ in Badegewässern im Zuge des Klimawandels

Kirschner, A. K. T., Rehm, C., Vierheilig, J. & Farnleitner, A. H., 2022, ÖWAV-Arbeitsbehelf 52, Mikrobiologie und Wasser - Teil 2: Fallstudien zur Illustration der neuen diagnostisch-analytischen Möglichkeiten. Farnleitner, A. H., Kirschner, A. K. T., Frick, C., Proksch, P., Vogl, W., Schauer, U., Schrammel, B. & Zibuschka, F. (Hrsg.). Wien, Österreich: Österreichischer Wasser- und Abfallwirtschaftsverband, Wien, S. 11-15 5 S.

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VIENNA WATER RESSOURCE SYSTEMS 2020+: Eine 8-jährige interdisziplinäre Forschungskooperation zur Bewältigung zukünftiger Herausforderungen der Wasserversorgung

Kolm, C., Mayer, R., Kirschner, A., Savio, D., Frick, C., Linke, R., Reischer, G., Nadiotis-Tsaka, T., Obeid, A., Jakwerth, S., Campostrini, L., Stevenson, M. E. & Ameen, A., 31 Mai 2022.

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Vollautomatisierte, schiffsgestützte Messungen der Enzymaktivität zur flächendeckenden Identifizierung von Hotspots fäkaler mikrobiologischer Einträge in großen Gewässern

Demeter, K., Stadler, P., Vogl, W., Savio, D., Derx, J., Kirschner, A. K. T., Zessner, M. & Farnleitner, A. H., 2022, ÖWAV-Arbeitsbehelf 52, Mikrobiologie und Wasser - Teil 2: Fallstudien zur Illustration der neuen diagnostisch-analytischen Möglichkeiten. Farnleitner, A. H., Kirschner, A. K. T., Frick, C., Proksch, P., Vogl, W., Schauer, U., Schrammel, B. & Zibuschka, F. (Hrsg.). Wien, Österreich: Österreichischer Wasser- und Abfallwirtschaftsverband, Wien, S. 20-24 5 S.

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Was bringen Ufergehölze für die Wasser- und Sedimentqualität von Bächen in landwirtschaftlichen Regionen?

Weigelhofer, G., Leopold, M., Akbari, E., Farnleitner, A. & Kirschner, A., 2022, in: Österreichische Wasser- und Abfallwirtschaft.

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Open Access

Wastewater-based epidemiology in countries with poor wastewater treatment - Epidemiological indicator function of SARS-CoV-2 RNA in surface waters

Kolarević, S., Micsinai, A., Szántó-Egész, R., Lukács, A., Kračun-Kolarević, M., Djordjevic, A., Vojnović-Milutinović, D., Marić, J. J., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. A. H., Linke, R., Đukic, A., Kostić-Vuković, J. & Paunović, M., 15 Okt. 2022, in: Science of the Total Environment. 843, S. 156964 156964.

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Open Access

3 Zitate (Scopus)

2021

A comprehensive, quantitative study concept on the occurrence and spread of human-induced antibiotic resistance in Lower Austrian rivers

Leopold, M., Kabicher, A., Koller, M., Linke, R. B., Kandler, W., Sulyok, M., Aspoeck, C., Pap, I.-J., Zarfel, G., Kittinger, C., Kirschner, A. & Farnleitner, A., 2021.

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A Novel Flow Cytometric Approach for the Quantification and Quality Control of Chlamydia trachomatis Preparations

Klasinc, R., Reiter, M., Digruber, A., Tschulenk, W., Walter, I., Kirschner, A., Spittler, A. & Stockinger, H., 12 Dez. 2021, in: Pathogens. 10, 12, 1617.

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Open Access

4 Zitate (Scopus)

Assessing biological stability in a porous groundwater aquifer of a riverbank filtration system: combining traditional cultivation-based and emerging cultivation-independent in situ and predictive methods

Kirschner, A. K. T., Lindner, G., Jakwerth, S., Vierheilig, J., van Driezum, I. H., Derx, J., Blaschke, A. P., Savio, D. & Farnleitner, A. H., 2021, in: Österreichische Wasser- und Abfallwirtschaft. 73, S. 490-500

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Open Access

Detection of SARS-CoV-2 RNA in the Danube River in Serbia associated with the discharge of untreated wastewaters

Kolarević, S., Micsinai, A., Szántó-Egész, R., Lukács, A., Kračun-Kolarević, M., Lundy, L., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. H., Djukic, A., Čolić, J., Nenin, T., Sunjog, K. & Paunović, M., 20 Aug. 2021, in: Science of the Total Environment. 783, S. 146967 146967.

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Open Access

29 Zitate (Scopus)

Extent and origin of fecal pollution in water and biofilms along the Danube River

Savio, D., Kirschner, A., Kolm, C., Farnleitner, A., Schachner, I., Vierheilig, J., Zarfel, G., Koller, M., Kittinger, C., Jakwerth, S., Ixenmaier, S. & Linke, R., 09 Juni 2021.

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Fäkale Kontaminationen von Wasser und Dimensionierung des Infektionsschutzes im Zeitalter von PCR-Analytik und Dosis- Wirkungs-Modellierung

Derx, J., Blaschke, A. P., Demeter, K., Kirschner, A. K. T., Linke, R., Sommer, R. & Farnleitner, A. H., Sept. 2021.

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Gefährdungs- & Risikoabschätzung fäkaler Kontaminationen von Wasser im Zeitalter von PCR-Analytik und Dosis-Wirkungs- Modellierung

Farnleitner, A. H., Blaschke, A. P., Demeter, K., Kirschner, A. K. T., Linke, R., Sommer, R. & Derx, J., 2021.

Publikation: Konferenzbeitrag › Mündlicher Konferenzbeitrag

Genetic microbial faecal source tracking: rising technology to support future water quality testing and safety management

Steinbacher, S. D., Savio, D., Demeter, K., Karl, M., Kandler, W., Kirschner, A. K. T., Reischer, G. H., Ixenmaier, S. K., Mayer, R. E., Mach, R. L., Derx, J., Sommer, R., Linke, R. & Farnleitner, A. H., 2021, in: Österreichische Wasser- und Abfallwirtschaft. 73, S. 468-481

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Open Access

Genetic Microbial Source Tracking Support QMRA Modeling for a Riverine Wetland Drinking Water Resource

Derx, J., Demeter, K., Linke, R., Cervero-Aragó, S., Lindner, G., Stalder, G., Schijven, J., Sommer, R., Walochnik, J., Kirschner, A. K. T., Komma, J., Blaschke, A. P. & Farnleitner, A. H., 14 Juli 2021, in: Frontiers in Microbiology. 12, S. 668778 668778.

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Open Access

10 Zitate (Scopus)

High persistence of genetic and cultivation-based bacterial fecal indicators in communal waste water at 5°C supports proportional autosampling procedures over 24h

Mayer, R., Linke, R., Vierheilig, J., Reischer, G., Mach, R. L., Kirschner, A. K. T., Zessner, M., Farnleitner, A. H. & Sommer, R., 2021, Abstracts.

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Beitrag in Konferenzband

How dead is dead? Viable but non-culturable versus persister cells

Kirschner, A. K. T., Vierheilig, J., Flemming, H.-C., Wingender, J. & Farnleitner, A. H., Juni 2021, in: Environmental Microbiology Reports. 13, 3, S. 243-245 3 S.

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12 Zitate (Scopus)

Identifying Inorganic Turbidity in Water Samples as Potential Loss Factor During Nucleic Acid Extraction: Implications for Molecular Fecal Pollution Diagnostics and Source Tracking

Linke, R. B., Zeki, S., Mayer, R., Keiblinger, K., Savio, D., Kirschner, A. K. T., Reischer, G. H., Mach, R. L., Sommer, R. & Farnleitner, A. H., 20 Okt. 2021, in: Frontiers in Microbiology. 12, S. 660566 660566.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift (peer-reviewed) › Artikel in Fachzeitschrift

Open Access

16 Zitate (Scopus)

Microbial faecal pollution and source tracking

Kirschner, A. K. T., Schachner, I., Jakwerth, S., Savio, D., Toth, E., Kolarevic, S., Kračun-Kolarević, M., Zarfel, G. E., Kittinger, C., Koller, M., Ixenmaier, S., Linke, R. & Farnleitner, A. H., 2021, Joint Danube Survey 4 Scientific Report: A shared Analysis of the Danube River. Vienna: ICPDR-International Commission for the Protection of the Danube River, S. 183-192

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Kapitel in Buch/Bericht

Microbiome: Microbial community and environmental DNA analysis

Sanseverino, I., Navarro Cuenca, A., Lahm, A., Petrillo, M., Fabbri, M., Gomez Cortes, L., Farnleitner, A. H., Kirschner, A. K. T., Zarfel, G., Zaccara, S. & Lettieri, T., 2021, Joint Danube Survey 4 Scientific Report: A shared Analysis of the Danube River. Vienna: ICPDR-International Commission for the Protection of the Danube River, S. 199-212

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Kapitel in Buch/Bericht

Modelling the fate and transport of microbial pathogens during floods and rainfall events in an alluvial wetland area supported by microbial source tracking

Derx, J., Linke, R., Demeter, K., Komma, J., Cervero-Aragó, S., Schijven, J., Sommer, R., Walochnik, J., Kirschner, A., Blaschke, A. P. & Farnleitner, A. H., 2021, EGU General Assembly 2021. Copernicus

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Open Access

Modelling the interplay of future changes and wastewater management measures on the microbiological river water quality considering safe drinking water production

Demeter, K., Derx, J., Komma, J., Parajka, J., Schijven, J., Sommer, R., Cervero-Aragó, S., Lindner, G., Zoufal-Hruza, C. M., Linke, R., Savio, D., Ixenmaier, S. K., Kirschner, A. K. T., Kromp, H., Blaschke, A. P. & Farnleitner, A. H., 10 Mai 2021, in: Science of the Total Environment. 768, S. 144278 144278.

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Open Access

20 Zitate (Scopus)

Occurence of non-wild type antibiotic resistant Escherichia coli in the River Danube

Dielacher, I., Hack, K., Jakwerth, S., Kolarevic, S., Kračun-Kolarević, M., Toth, E., Savio, D., Farnleitner, A. H., Kittinger, C., Kirschner, A. K. T., Zarfel, G. & Koller, M., 2021, Joint Danube Survey 4 Scientific Report: A shared Analysis of the Danube River. Vienna: ICPDR-International Commission for the Protection of the Danube River, S. 193-198

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Kapitel in Buch/Bericht

Using hydrodynamic and hydraulic modelling to study microbiological water quality issues at a backwater area of the Danube to support decision-making

Derx, J., Komma, J., Reiner, P., Vierheilig, J., Savio, D., Sommer, R., Kirschner, A. K. T., Frick, C., Linke, R., Farnleitner, A. H. & Blaschke, A. P., 2021, in: Österreichische Wasser- und Abfallwirtschaft. 73, S. 482-489

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Open Access

2020

Automated online monitoring of fecal pollution in water by enzymatic methods

Demeter, K., Burnet, J. B., Stadler, P., Kirschner, A., Zessner, M. & Farnleitner, A. H., Aug. 2020, in: Current Opinion in Environmental Science and Health. 16, S. 82-91 10 S.

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Open Access

10 Zitate (Scopus)

DNA aptamers against bacterial cells can be efficiently selected by a SELEX process using state-of-the art qPCR and ultra-deep sequencing

Kolm, C., Cervenka, I., Aschl, U. J., Baumann, N., Jakwerth, S., Krska, R., Mach, R. L., Sommer, R., DeRosa, M. C., Kirschner, A. K. T., Farnleitner, A. H. & Reischer, G. H., 01 Dez. 2020, in: Scientific Reports. 10, 1, S. 20917 20917.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift (peer-reviewed) › Artikel in Fachzeitschrift

Open Access

37 Zitate (Scopus)

Elucidating fecal pollution patterns in alluvial water resources by linking standard fecal indicator bacteria to river connectivity and genetic microbial source tracking

Frick, C., Vierheilig, J., Nadiotis-Tsaka, T., Ixenmaier, S., Linke, R., Reischer, G. H., Komma, J., Kirschner, A. K. T., Mach, R. L., Savio, D., Seidl, D., Blaschke, A. P., Sommer, R., Derx, J. & Farnleitner, A. H., 01 Okt. 2020, in: Water Research. 184, S. 116132 116132.

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Open Access

20 Zitate (Scopus)

Global emergence of environmental non-O1/O139 Vibrio cholerae infections linked with climate change: a neglected research field?

Vezzulli, L., Baker-Austin, C., Kirschner, A., Pruzzo, C. & Martinez-Urtaza, J., 01 Okt. 2020, in: Environmental Microbiology. 22, 10, S. 4342-4355 14 S.

Publikation: Beitrag in Fachzeitschrift (peer-reviewed) › Artikel in Fachzeitschrift

47 Zitate (Scopus)

Identifying faecal pollution sources in urban surface water resources to support water safety management

Kilic, H. S., Cervero-Aragó, S., Frick, C., Linke, R., Schijven, J., Kirschner, A., Lindner, G., Walochnik, J., Sommer, R., Blaschke, A. P., Farnleitner, A. H. & Derx, J., 2020, First International Conference on Urban Water Interfaces (UWI).

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Microbiological Water Quality of Rivers in Montenegro

Kolarević, S., Kračun-kolarević, M., Jovanović, J., Ilić, M., Paunović, M., Kostić-vuković, J., Martinović, R., Jokanović, S., Joksimović, D., Pešić, V., Kirschner, A. K. T., Linke, R., Ixenmaier, S., Farnleitner, A., Savio, D., Reischer, G., Tomić, N. & Vuković-gačić, B., 2020, The Handbook of Environmental Chemistry. Springer Verlag, Band 93. S. 135-155 21 S. (Handbook of Environmental Chemistry; Band 93).

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5 Zitate (Scopus)

2019

Antimicrobial resistance properties within a Vibrio cholerae non-O1/non-139 population from a large Austrian lake: 8th Biennial International Conference on the Biology of Vibrios (ICBV), November 17-20, 2019, Montreal, Canada

Kirschner, A. K. T., Lepuschitz, S., Larvor, E., Granier, S. A., Pretzer, C., Mach, R. L., Farnleitner, A. H., Ruppitsch, W., Pleininger, S., Indra, A. & Baron, S., 2019.

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Bakterien im Trinkwasser: Freunde oder Feinde? FORUM Wasserhygiene Kongress, 23.10.2019, Wien, Österreich

Kirschner, A. K. T., 2019.

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Combining flow cytometric and taxonomic analysis of bacterial community dynamics to study the biostability of drinking water resources -Part 1: Flow cytometric determination of microbial cell numbers

Vierheilig, J., Savio, D. F., Jakwerth, S., Karl, M., Goll, T., Fiedler, F., Brandl, H., Kandler, W., Sommer, R., Farnleitner, A. H. & Kirschner, A. K. T., 2019, Abstractbook.

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Beitrag in Konferenzband

Combining flow cytometric and taxonomic analysis of bacterial community dynamics to study the biostability of drinking water resources – Part 1: Flow cytometric determination of microbial cell numbers: 20th International Symposium on Health-Related Water Microbiology (HRWM), 15-20 September 2019, Vienna, Austria

Vierheilig, J., Savio, D., Jakwerth, S., Karl, M., Goll, T., Fiedler, F., Brandl, H., Kandler, W., Sommer, R., Farnleitner, A. H. & Kirschner, A. K. T., 2019.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Combining flow cytometric and taxonomic analysis of bacterial community dynamics to study the biostability of drinking water resources -Part 2: High throughput 16S rRNA gene amplicon sequencing

Savio, D. F., Vierheilig, J., Karl, M., Houdek, J., Jakwerth, S., Fiedler, F., Goll, T., Brandl, H., Kandler, W., Sommer, R., Kirschner, A. K. T. & Farnleitner, A. H., 2019, Abstractbook.

Publikation: Beitrag in Buch/Bericht/Konferenzband › Beitrag in Konferenzband

Combining flow cytometric and taxonomic analysis of bacterial community dynamics to study the biostability of drinking water resources – Part 2: High-throughput 16S rRNA gene amplicon sequencing: 20th International Symposium on Health-Related Water Microbiology (HRWM), 15-20 September 2019, Vienna, Austria

Savio, D., Vierheilig, J., Karl, M., Houdek, J., Jakwerth, S., Fiedler, F., Goll, T., Brandl, H., Kandler, W., Sommer, R., Kirschner, A. K. T. & Farnleitner, A. H., 2019.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Determination of provisional epidemiological cut-off values (COWT): a first step to monitor antimicrobial resistance in Vibrio cholerae non-O1/non-O139 isolates: 8th Biennial International Conference on the Biology of Vibrios (ICBV), November 17-20, 2019, Montreal, Canada

Baron, S., Larvor, E., Jouy, E., Kempf, I., Chevalier, S., Granier, S. A., Boncy, J., Rossignol, E., Piarroux, R., Kirschner, A. K. T., Lesne, J. & Smith, P., 2019.

Publikation: Konferenzbeitrag › Konferenzposter

Alexander Kirschner

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